1.脓肿一次性切开手术法
主要是适用于浅部的脓肿，切口成放射状，长度应该与脓肿等长，可以引流通畅，同时要寻找齿状线附近的感染的肛隐窝或者内口，将内口与切口之间的组织完全切开，并搜刮清楚以免形成肛瘘。
2.一次切开挂线手术法
适用于高位脓肿，比如说，肛隐窝感染而导致坐骨直肠窝脓肿，骨盆直肠间隙脓肿以及马蹄形脓肿等等。
3.分次手术法
主要是适用于体质比较虚弱或者不愿意住院治疗的深部脓肿，切口应该在压痛或者波动明显的部位,尽可能的靠近肛门，切口成糊状或者放射状，而且必须有足够的长度以保持引流通畅，形成肛瘘以后按照肛瘘处理，病变炎症局限和全身状况良好的可以采用二次手术，必要的时候要配合足量的抗生素控制术后感染。